Koszt hydroizolacji dachu zależy od wielu czynników: powierzchni, rodzaju użytych materiałów, technologii aplikacji oraz stanu technicznego istniejącego pokrycia. W przypadku nowych dachów płaskich lub przy gruntownej renowacji, ceny mogą się znacząco różnić. Przykładowo, za aplikację płynnej membrany poliuretanowej w systemie dwuwarstwowym trzeba zapłacić od 60 do 120 zł/m² (materiał + robocizna). Dla porównania, papy termozgrzewalne kosztują średnio 30–70 zł/m², ale wymagają zgrzewania i są bardziej czasochłonne w montażu.
Dodatkowe koszty mogą pojawić się przy konieczności naprawy podłoża, wykonaniu warstw spadkowych lub zastosowaniu detali systemowych (np. taśm uszczelniających, obróbek blacharskich, kołnierzy przy kominach). Warto pamiętać, że inwestycja w dobrej jakości hydroizolację to nie tylko zabezpieczenie przed przeciekami, ale również przedłużenie żywotności całej konstrukcji dachowej. Najlepiej postawić na kompletne systemy renomowanych producentów, które zapewniają kompatybilność wszystkich komponentów i długoterminową gwarancję szczelności.